研究与进展
周曹屹, 裴文锋, 张滋林, 宋吉坤, 张兵兵, 贾冰, 冯盼, 吴嫚, 于霁雯, 郑凯, 王莉, 赛热比艳·阿布都加帕尔, 王刚, 陈全家
【目的】叉头框蛋白G1(forkhead box protein G1, FOXG1)作为转录因子在细胞增殖和分化过程中起关键作用。目前,FOXG1基因家族在棉花中尚未得到系统研究。本文旨在对棉花中该基因家族进行鉴定分析。【方法】利用生物信息学方法鉴定棉花FOXG1基因家族成员,分析蛋白的理化性质、保守基序及系统进化关系。利用转录组数据分析陆地棉和海岛棉中FOXG1基因的表达模式。通过陆地棉FOXG1基因的单倍型与纤维品质性状的关联分析以及在拟南芥中转基因超表达GhFOXG1-4基因,初步探究FOXG1基因的功能。【结果】在陆地棉、海岛棉、雷蒙德氏棉、亚洲棉、毛棉、黄褐棉、达尔文氏棉、草棉中分别鉴定到6个、5个、3个、3个、6个、6个、6个、3个FOXG1基因,这38个FOXG1蛋白和拟南芥的3个FOXG1蛋白可分为4个亚群。GhFOXG1-1在花药和胚珠中的表达量较高,GhFOXG1-2、GbFOXG1-1和GbFOXG1-2在花药、胚珠和纤维组织中高表达,GhFOXG1-4在胚珠中的表达量较高。GhFOXG1-4和GhFOXG1-5分别有2种、3种单倍型,单倍型间的纤维上半部平均长度、断裂比强度和马克隆值存在显著差异。过表达GhFOXG1-4基因的拟南芥茎细胞宽度显著大于野生型。【结论】在8个棉种中共鉴定出38个FOXG1基因,部分GhFOXG1基因的优异单倍型具有协同改良纤维品质的潜力,GhFOXG1-4正调控拟南芥茎细胞宽度,为后续研究FOXG1家族基因的功能奠定了基础。