棉 花 学 报 Cotton Science 2009,21(6):462-467
棉花多抗品种中植棉 KV-1 抗病基因同源序列的克隆与分析 摘要:许多抗病基因都具有核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸重复区(LRR)。根据已知的 NBS-LRR 类抗病基因的保守序列,分别设计一对简并引物和一对特异引物,用以扩增棉花基因组中的抗病基因同源序列。获得一条大小约 500 bp 的扩增片段,克隆测序后得到 10 条 NBS-LRR 类 RGAs。推导的氨基酸均具有抗病基因的 P-loop(kinase-1a)、kinase-2、kinase-3a 及 GLPL 区。同源性比较发现,其中 1 条属于 TIR-NBS-LRR 类,其余 9 条属于 non-TIR-NBS-LRR 类。1 条 TIR-NBS-LRR 类 RGAs 与已克隆的 N、L6、M 等抗病基因的同源性为 51%-60%,9 条 non-TIR-NBS-LRR 类 RGAs 与已克隆的 RPS5、RPR1、Xa1 等抗病基因的同源性为 51%-60%。这些抗病基因同源序列(RGAs)可作为分子标记筛选棉花的抗病候选基因。
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