%0 Journal Article %A 刘娜 %A 吴金华 %A 安亚茹 %A 杨君 %A 张艳 %A 王省芬 %A 马峙英 %T 陆地棉抗坏血酸过氧化物酶基因家族全基因组生物信息学分析 %D 2017 %R 10.11963/issn.1002-7807.201701003 %J 棉花学报 %P 17-28 %V 29 %N 1 %X 目的 抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)是过氧化物酶家族中的1类成员,可以清除活性氧。APX家族的生物信息学分析有助于更好地了解该家族基因。方法 利用生物信息学方法,从中国农业科学院棉花研究所提供的陆地棉序列中鉴定出14条APX基因家族序列,并对这14个成员的染色体定位、亚细胞定位、进化关系、理化性质、信号肽、保守基序以及其编码蛋白的结构特征进行了预测分析,并初步分析了部分基因的表达。结果 APX基因分布广泛,分散在不同的染色体上;且大部分APX蛋白定位在细胞质,是亲水性脂溶蛋白;有3个保守基序,保守性较强;基因起源和进化比较复杂;二级结构的主要元件为α-螺旋和无规则卷曲。根据表达分析推测,第1亚组和第2亚组的基因在棉纤维发育的不同时期起作用。结论 这些结果有望为APX家族成员的结构与功能挖掘提供参考。

%U https://journal.cricaas.com.cn/Jweb_mhxb/CN/10.11963/issn.1002-7807.201701003