%0 Journal Article %A 石荣康 %A 张冬梅 %A 孙正文 %A 刘正文 %A 解美霞 %A 张艳 %A 马峙英 %A 王省芬 %T 陆地棉REM基因家族全基因组鉴定及表达分析 %D 2021 %R 10.11963/1002-7807.srkwxf.20210113 %J 棉花学报 %P 95-111 %V 33 %N 2 %X

【目的】 REM (Reproductive meristem)基因家族编码一类转录因子在植物生长发育过程中发挥重要作用,但在棉花中未见报道。【方法】 基于陆地棉基因组数据和公共数据库中的转录组数据,运用生物信息学方法对陆地棉REM基因家族成员进行系统鉴定,并对该基因家族的理化性质、基因结构、组织表达特异性以及胁迫条件下的表达规律等进行分析。【结果】 陆地棉REM基因家族包含79个成员,分布在25条染色体上,可分为5个亚组。每个成员编码的蛋白质至少含有1个B3结构域,大部分定位在细胞核。基因上游2 kb序列中存在激素及胁迫响应等顺式作用元件。组织表达特性分析结果显示,大部分REM基因在胚珠或纤维中的表达量较其他组织更高。逆境胁迫下的表达分析显示,29个基因响应棉花冷、热、盐或干旱胁迫。对6个基因在纤维不同发育时期表达量进行分析,发现这些基因的表达与已发表的转录组数据基本一致。【结论】 明确了REM基因家族在基因组中的分布特征、结构特征以及系统进化特征,根据转录组数据初步揭示了该家族基因在生长发育和抗逆中的功能。

%U https://journal.cricaas.com.cn/Jweb_mhxb/CN/10.11963/1002-7807.srkwxf.20210113