棉 花 学 报 Cotton Science 2010, 22(1):23-29

 

 

 

棉花阿拉伯半乳糖蛋白基因的克隆、表达与染色体定位分析
王 磊,田亮亮,朱一超, 蔡彩萍,赵 亮,张天真,郭旺珍﹡
(南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏 南京 210095)

摘要:陆地棉李氏超短纤维突变体( Li1li1 )是显性单基因突变体,表现为茎秆、叶片卷曲,纤维短至 6 mm ,其隐性纯合体( li1li1 )则表现为株型和纤维发育都正常。对开花后 10 d 的李氏纤维发育正常材料( li1li1 )和超短纤维突变体( Li1li1 )胚珠纤维混合体进行 mRNA 差异显示反转录 PCR ( DDRT-PCR )分析,获得 1 条在李氏纤维发育正常材料中上调表达的差异片段。进一步通过 5'RACE 技术获得全长为 621 bp 的 cDNA ,测序及 DNA 序列的生物信息学分析表明该 cDNA 片段与拟南芥编码阿拉伯半乳糖蛋白基因 AGP14 有 52% 相似性,故命名为 GhAGP 。表达特征分析表明,该基因在陆地棉根、茎、叶和纤维中组成性表达,在棉纤维中优势表达。基因组序列分析显示,该基因在二倍体棉种非洲棉和雷蒙德氏棉中各有 1 个拷贝,在四倍体棉种陆地棉 TM-1 和海岛棉海 7124 中分别存在 2 个拷贝,表明 A 、 D 亚组中各有 1 个拷贝。利用本实验室陆地棉遗传标准系 TM-1 和海岛棉海 7124 培育的含 140 个单株的 BC1 作图群体,将 GhAGP 基因的 2 个拷贝分别定位在四倍体棉花部分同源转化群染色体 6 和染色体 25 上。
关键词:棉花;纤维突变体;阿拉伯半乳糖基因;克隆;表达;基因定位
中图分类号:S562.035      文献标识码:A
文章编号:1002-7807(2010)01-0023-07    [全文,1470KB]