棉 花 学 报   Cotton Science   2007，19(4)：243-247

棉花生长素结合蛋白ABP1基因cDNA的克隆及序列分析
孙建波，崔百明，刘德兵，彭  明^*
（中国热带农业科学院热带生物技术研究所，热带生物技术国家重点实验室，海口 571101）

摘要：生长素结合蛋白(ABP1)在植物细胞发育中起着重要作用。在ABP1蛋白的保守区设计引物，利用RT-PCR和RACE方法，首次克隆了棉花ABP1基因cDNA的3′和5′末端。测序及生物信息学分析表明，该基因cDNA全长824bp编码190个氨基酸，它所编码的氨基酸序列包含植物ABP1蛋白家族的所有特征，被命名为GhABP1。棉花ABP1所包含的Box A，Box B和Box C区在植物 ABP1家族中是高度保守的。它的C末端氨基酸残基WDE在蛋白质的折叠及ABP1在质膜上的功能活性方面都具有重要的作用。棉花 ABP1的C末端带有KDEL残基区，这个KDEL区表明它被定位在内质网上。
     用Clustal W 软件进行多重比对分析表明，棉花ABP1与拟南芥、向日葵、油菜、辣椒、甘菊的氨基酸序列同源性分别为72％，72％，71％，70％和70％。系统进化分析表明，棉花在进化上与萝卜、拟南芥和油菜聚为一类。序列分析表明此基因为生长素结合蛋白基因家族的新成员。
关键词：棉花；ABP1；基因克隆；基因分析
中图分类号：S562.035     文献标识码：A
文章编号：1002-7807（2007）04-0243-05   [全文，2207KB]